Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gcn1E9PVA8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gcn1E9PVA8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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