Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Piezo1E2JF22 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms