Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms