Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms