Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

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Length 719 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm28043E0CXC2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm28043E0CXC2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28043E0CXC2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28043E0CXC2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28043E0CXC2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28043E0CXC2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm28043E0CXC2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm28043E0CXC2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28043E0CXC2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28043E0CXC2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28043E0CXC2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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