Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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