Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms