Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CatipB9EKE5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms