Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms