Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms