Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms