Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Abcc8B2RUS7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Abcc8B2RUS7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms