Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms