Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms