Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf3B2RQG2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms