Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms