Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ssxb8B1AY40 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ssxb8B1AY40 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ssxb8B1AY40 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ssxb8B1AY40 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ssxb8B1AY40 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ssxb8B1AY40 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ssxb8B1AY40 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ssxb8B1AY40 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssxb8B1AY40 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssxb8B1AY40 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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