Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms