Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf25B1AWN9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms