Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms