Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Grik3B1AS29 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Grik3B1AS29 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Grik3B1AS29 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Grik3B1AS29 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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