Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms