Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms