Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr16A3KMN5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms