Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup62clA2AG10 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62clA2AG10 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms