Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms