Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms