Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calcoco2A2A6M5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms