Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171a2A2A699 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms