Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms