Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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