Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms