Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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