Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria4Q9Z2W8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms