Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcniQ9Z2V9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms