Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms