Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms