Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms