Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms