Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk1bQ9Z2C6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk1bQ9Z2C6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Upk1bQ9Z2C6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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