Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2aQ9Z255 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms