Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lgr5Q9Z1P4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms