Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nfs1Q9Z1J3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfs1Q9Z1J3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms