Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf394Q9Z1D9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms