Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ror1Q9Z139 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms