Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms