Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip2Q9Z0H8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms