Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp2Q9Z0E6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms