Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms