Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms